Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nhsl1Q8CAF4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms