Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4aQ8C9S8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4aQ8C9S8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4aQ8C9S8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4aQ8C9S8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4aQ8C9S8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg4aQ8C9S8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4aQ8C9S8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4aQ8C9S8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4aQ8C9S8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4aQ8C9S8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg4aQ8C9S8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg4aQ8C9S8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Atg4aQ8C9S8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Atg4aQ8C9S8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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