Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfibp1Q8C8U0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms