Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot2Q8C5L3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot2Q8C5L3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms