Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc2Q8BZW8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms