Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup54Q8BTS4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms