Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tnrc6bQ8BKI2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnrc6bQ8BKI2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms