Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynprQ8BGN8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynprQ8BGN8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms