Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Liat1Q810M6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Liat1Q810M6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms