Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm5bQ80Y84 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm5bQ80Y84 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms