Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrfn4Q80XU8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms