Protein–RNA interactions for Protein: Q80X59

Tmco5b, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5bQ80X59 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco5bQ80X59 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco5bQ80X59 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco5bQ80X59 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco5bQ80X59 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco5bQ80X59 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco5bQ80X59 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco5bQ80X59 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco5bQ80X59 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmco5bQ80X59 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmco5bQ80X59 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmco5bQ80X59 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco5bQ80X59 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco5bQ80X59 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco5bQ80X59 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco5bQ80X59 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco5bQ80X59 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco5bQ80X59 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco5bQ80X59 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco5bQ80X59 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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