Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pcsk9Q80W65 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pcsk9Q80W65 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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