Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Avl9Q80U56 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Avl9Q80U56 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms