Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc42bpbQ7TT50 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc42bpbQ7TT50 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms