Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PhkbQ7TSH2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PhkbQ7TSH2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PhkbQ7TSH2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PhkbQ7TSH2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PhkbQ7TSH2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms