Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Actn1Q7TPR4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actn1Q7TPR4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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