Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stk40Q7TNL3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stk40Q7TNL3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stk40Q7TNL3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stk40Q7TNL3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stk40Q7TNL3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stk40Q7TNL3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stk40Q7TNL3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stk40Q7TNL3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms