Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Eci3Q78JN3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms