Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme8Q715T0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nme8Q715T0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms