Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SynmQ70IV5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms