Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms