Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ncapd3Q6ZQK0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms