Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shc4Q6S5L9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms