Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptx4Q6RUU0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptx4Q6RUU0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms