Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKN7

Inca1, Protein INCA1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Inca1Q6PKN7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Inca1Q6PKN7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Inca1Q6PKN7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Inca1Q6PKN7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Inca1Q6PKN7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Inca1Q6PKN7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Inca1Q6PKN7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms