Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med16Q6PGF3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med16Q6PGF3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms