Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HjurpQ6PG16 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms