Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rasa4Q6PFQ7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rasa4Q6PFQ7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms