Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85bQ6PDY0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc85bQ6PDY0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms