Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trak1Q6PD31 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trak1Q6PD31 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trak1Q6PD31 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms