Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tsen2Q6P7W5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsen2Q6P7W5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms