Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slx4Q6P1D7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slx4Q6P1D7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms