Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Szrd1Q6NXN1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms