Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SphkapQ6NSW3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms