Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arhgap20Q6IFT4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms