Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ScapQ6GQT6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScapQ6GQT6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms