Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg9bQ6EBV9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg9bQ6EBV9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms