Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Pdzrn3Q69ZS0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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Pdzrn3Q69ZS0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Pdzrn3Q69ZS0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Pdzrn3Q69ZS0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Pdzrn3Q69ZS0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Pdzrn3Q69ZS0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Pdzrn3Q69ZS0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Pdzrn3Q69ZS0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Pdzrn3Q69ZS0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdzrn3Q69ZS0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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