Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z66

Mysm1, Histone H2A deubiquitinase MYSM1, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mysm1Q69Z66 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mysm1Q69Z66 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms