Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spty2d1Q68FG3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spty2d1Q68FG3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms