Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CltcQ68FD5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CltcQ68FD5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms