Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms