Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Sp9Q64HY3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Sp9Q64HY3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Sp9Q64HY3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Sp9Q64HY3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sp9Q64HY3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms