Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Zeb1Q64318 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zeb1Q64318 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zeb1Q64318 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms