Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irf4Q64287 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irf4Q64287 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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