Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PatjQ63ZW7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PatjQ63ZW7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.7 ms