Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pou4f3Q63955 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms