Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SspnQ62147 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SspnQ62147 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SspnQ62147 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SspnQ62147 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SspnQ62147 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SspnQ62147 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SspnQ62147 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SspnQ62147 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SspnQ62147 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SspnQ62147 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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