Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf1Q61999 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf1Q61999 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf1Q61999 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf1Q61999 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf1Q61999 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf1Q61999 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Odf1Q61999 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Odf1Q61999 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Odf1Q61999 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Odf1Q61999 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Odf1Q61999 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Odf1Q61999 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Odf1Q61999 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Odf1Q61999 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Odf1Q61999 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf1Q61999 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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